【肽科普】從合成到純化的綠色可持續(xù)性挑戰(zhàn)
1
引言
多肽是由氨基酸縮合連接而成的,具有一定生物活性的化合物分子。相對于蛋白質(zhì)物質(zhì),空間結(jié)構(gòu)較為簡單、穩(wěn)定性較高,且具有較低的免疫原性。可作用于皮膚系統(tǒng)、肌肉骨骼系統(tǒng)、血液系統(tǒng)、心血管系統(tǒng)、內(nèi)分泌系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)等。隨著生物技術(shù)、合成技術(shù)及分析技術(shù)的快速發(fā)展,多肽已成為一個(gè)重要的生命科學(xué)研究領(lǐng)域。如今多肽產(chǎn)品已在醫(yī)療、保健食品、化妝品、新材料等眾多領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,尤其是在醫(yī)藥領(lǐng)域,多肽藥物正發(fā)揮越來越重要的作用。
2
合成多肽引發(fā)的功效工業(yè)革命
從發(fā)現(xiàn)至今,合成多肽的發(fā)展也帶動了整個(gè)多肽產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展,可以說在近30年,也是功效工業(yè)革命的引領(lǐng)者。
合成多肽來源主要有化學(xué)合成和生物合成兩種途徑,相比較于生物合成存在高效表達(dá)等技術(shù)難題且成本昂貴,難以用于規(guī)模生產(chǎn),化學(xué)合成的多肽擁有無與倫比的優(yōu)勢,包括生產(chǎn)成本可控,氨基酸長度可控,尤其對與小分子寡肽類優(yōu)勢更加明顯,雜質(zhì)成分可控,可制定相對準(zhǔn)確的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),易于工業(yè)化生產(chǎn);同時(shí)最大特色對于一些非天然存在的多肽種類(如乙酰基六肽-8不是天然存在的多肽)可以規(guī)?;煽厣a(chǎn)?;瘜W(xué)合成多肽已經(jīng)成為目前多肽的一種主流合成方法,尤其在藥品領(lǐng)域,基本都是化學(xué)合成多肽,酶解與基因工制成的多肽非常少見。
化學(xué)合成多肽的研究包含固相合成樹脂,多肽縮合試劑,氨基酸保護(hù)基的研究,并在此基礎(chǔ)上推動可持續(xù)性,綠色化學(xué)方面的多肽合成研究。90年代,合成多肽的研究及應(yīng)用進(jìn)入空前繁榮局面。
3
綠色化學(xué)合成多肽是未來趨勢
隨著多肽藥物研究和發(fā)展,人們對多肽的需求不斷上升,多肽行業(yè)規(guī)模在快速增長,同時(shí)也對多肽制藥工藝提出了更高的安全、環(huán)保要求。在現(xiàn)階段,單批次千克級的合成開始變得普遍,合成和純化過程中使用大量有機(jī)溶劑,對環(huán)保和可持續(xù)性因素產(chǎn)生了重大影響。其中一些包括:原子經(jīng)濟(jì)性極差導(dǎo)致產(chǎn)生大量危險(xiǎn)的化學(xué)廢物、多肽生產(chǎn)成本高昂等問題。因此,綠色可持續(xù)性的多肽合成已成為關(guān)注熱點(diǎn)。2019年,美國化學(xué)會(ACS)-圓桌會議小組對此發(fā)表了一篇關(guān)于多肽綠色可持續(xù)合成的綜述。文章中重點(diǎn)關(guān)注可持續(xù)性的綠色多肽合成技術(shù),包括合成及純化方法,從研發(fā)到生產(chǎn)的綠色合成探索,并分析了當(dāng)前多肽合成和純化在可持續(xù)性方面面臨的挑戰(zhàn)。目前,這些技術(shù)雖然可能還未能大規(guī)模產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用于多肽生產(chǎn),但我們相信,綠色合成多肽必然會帶來一番全新的局面,給多肽行業(yè)從業(yè)者指引新的方向,促進(jìn)行業(yè)快速健康發(fā)展。
為了幫助大家更好地了解綠色可持續(xù)性合成多肽,我們對全文進(jìn)行了翻譯,供大家參考,希望對大家在多肽制備工藝上有新的指引。
全文翻譯如下:
(由于小編能力有限,部分翻譯內(nèi)容可能存在誤區(qū),請大家見諒)
摘要
近年來,制藥行業(yè)對治療性多肽的興趣與日俱增,市場上有超過 50 種多肽藥物,約 170 種處于臨床試驗(yàn)階段,超過 200 種處于臨床前開發(fā)階段。然而,目前肽合成技術(shù)主要涉及使用大量高危試劑和溶劑的傳統(tǒng)技術(shù),很少關(guān)注綠色化學(xué)和工程。2016 年,ACS 綠色化學(xué)研究所制藥圓桌會議將肽 API 的綠色工藝開發(fā)確定為一個(gè)關(guān)鍵的未滿足需求,因此,成立了一個(gè)新的圓桌會議團(tuán)隊(duì)來解決這一重要領(lǐng)域。這個(gè)新團(tuán)隊(duì)的最初重點(diǎn)是突出肽合成的最佳實(shí)踐并鼓勵(lì)急需的創(chuàng)新。在這個(gè)觀點(diǎn)中,我們旨在總結(jié)當(dāng)前多肽合成和純化在可持續(xù)性方面面臨的挑戰(zhàn),強(qiáng)調(diào)可能的解決方案,并鼓勵(lì)學(xué)術(shù)界、制藥業(yè)和合同研究組織/合同制造組織之間的協(xié)同作用。
前言
美國化學(xué)學(xué)會 (ACS) 是世界上最大的科學(xué)學(xué)會,它是 ACS 綠色化學(xué)研究所 (GCI) 的主辦單位,其使命是在全球化工企業(yè)和整個(gè)社會中促進(jìn)和推動綠色和可持續(xù)化學(xué)與工程的實(shí)施。[1]為滿足其加快綠色化學(xué)工業(yè)應(yīng)用的重點(diǎn),ACS GCI 發(fā)起了一系列工業(yè)、非競爭性合作(稱為圓桌會議)。2005 年,ACS GCI 制藥圓桌會議 (GCIPR) 由三家公司組成,現(xiàn)已成為會員 到 2019 年已經(jīng)增長到 29 家。
早些年,圓桌會議專注于小分子化學(xué),但逐漸發(fā)展到滿足行業(yè)更廣泛的需求和利益。這包括大分子,這是圓桌會議綠色生物制劑團(tuán)隊(duì)的主要關(guān)注點(diǎn)。[2,3]此外,一個(gè)新興的重要領(lǐng)域是“中分子”的概念,通常是合成生產(chǎn)的,比標(biāo)準(zhǔn)小分子大,包括肽等形式。這些“中等分子”可以粗略地定義為分子量范圍在 1000 到 5000 Da 之間的 API。許多肽產(chǎn)品符合這一定義,并且是生物制藥行業(yè)中一個(gè)顯著增長的領(lǐng)域,市場上有 50 多種肽藥物,約 170 種處于臨床試驗(yàn)階段,超過 200 種處于臨床前開發(fā)階段。[4]然而,目前肽合成技術(shù)的發(fā)展水平主要涉及使用大量高危試劑和溶劑的傳統(tǒng)技術(shù),很少關(guān)注綠色化學(xué)和工程。[5]例如,大部分副產(chǎn)廢物流是用于固相肽合成 (SPPS) 的有害溶劑 N,N-二甲基甲酰胺 (DMF) 和 N-甲基-2-吡咯烷酮 (NMP)。許多更綠色的溶劑應(yīng)該在這個(gè)領(lǐng)域找到實(shí)用性,但需要付出巨大的努力,因?yàn)檫@些過程中的大多數(shù)是由制造商使用幾十年前的實(shí)踐操作的,而綠色化學(xué)并不是一個(gè)重點(diǎn)領(lǐng)域。導(dǎo)致環(huán)境狀況不佳的另一個(gè)原因是色譜法的普遍和廣泛使用來生產(chǎn)具有所需質(zhì)量屬性的肽產(chǎn)品。2016 年,ACS GCI 制藥圓桌會議將開發(fā)更環(huán)保的肽工藝確定為一個(gè)關(guān)鍵的未滿足需求,并成立了一個(gè)新的圓桌會議團(tuán)隊(duì)來解決這一重要領(lǐng)域。該小組的最初重點(diǎn)是突出當(dāng)前肽合成的最佳實(shí)踐并鼓勵(lì)更多需要的創(chuàng)新。從這個(gè)角度來看,我們旨在總結(jié)當(dāng)前肽合成和純化在可持續(xù)性方面面臨的挑戰(zhàn),并強(qiáng)調(diào)可能的解決方案。
01
化學(xué)肽合成的經(jīng)典方法
1.1
液相肽合成 (LPPS)
肽的早期合成是在溶液中進(jìn)行的,需要仔細(xì)操作保護(hù)基團(tuán)和多個(gè)具有挑戰(zhàn)性的后處理和分離。[6]使用這種方法學(xué)對于合成更長和更復(fù)雜的肽可能會有問題,但對于較短的肽和片段仍然有效。[7]
1.2
固相肽合成 (SPPS)
Bruce Merrifield 的開創(chuàng)性工作引入了固相肽合成 (SPPS),極大地簡化了試劑和溶劑等非束縛物質(zhì)的去除。[8-10]這種方法為自動化合成打開了大門。[11-14]因此,使用SPPS合成了許多具有挑戰(zhàn)性的肽。[15-18]最初,以Boc法為主,隨后,F(xiàn)moc/t Bu 策略獲得流行,F(xiàn)moc避免了使用從固體載體上裂解和最終脫保護(hù)所使用的危險(xiǎn)HF。[19,20]然而,SPPS遠(yuǎn)非完美,尤其是在綠色方面。典型的合成需要過量的氨基酸、偶聯(lián)試劑和堿,以在每個(gè)步驟中實(shí)現(xiàn)最大轉(zhuǎn)化。此外,F(xiàn)moc 氨基酸可以被認(rèn)為具有低劣的綠色證書,因?yàn)樗鼈兊脑咏?jīng)濟(jì)性非常差,經(jīng)常被忽視的是使用大量過量的哌啶(>20 equiv)來推動 Fmoc 的完全去除。這些過程還依賴于在每次操作后使用大量過量的溶劑來清洗樹脂。這導(dǎo)致過程質(zhì)量強(qiáng)度增加(PMI:所有輸入材料的總質(zhì)量與分離產(chǎn)品質(zhì)量的比率)和比小分子高得多的商品成本。疏水肽的合成帶來了額外的挑戰(zhàn),因?yàn)椴粩嘣鲩L的肽鏈的聚集是一個(gè)常見問題。[21,22]通常,需要使用專門的樹脂、溶劑和較低的樹脂負(fù)載量,從而進(jìn)一步影響工藝的綠色和商品成本。[23-25]
02
肽合成的可持續(xù)性
2.1
改進(jìn)經(jīng)典合成方法
2.1.1 耦合劑
盡管酰胺鍵的形成是制藥工業(yè)中最突出的轉(zhuǎn)化之一,但它仍然缺乏通用和穩(wěn)健的催化方法。Beller、Milstein、Goo?en 和 Sheppard 的出色報(bào)告為未來的發(fā)展鋪平了道路,[26-30]但要達(dá)到成熟和可行的催化協(xié)議在活性藥物成分(API)中的應(yīng)用還有很長的路要走。僅從毒理學(xué)和監(jiān)管的角度來看,API中過渡金屬的殘留水平需要非常低,通常為10 ppm或以下,這進(jìn)一步增加了技術(shù)挑戰(zhàn)。
因此,目前肽合成中的大多數(shù)酰胺偶聯(lián)方案都涉及使用苯并三唑衍生物。其中的關(guān)鍵例子是脲/胺鹽 HATU、HCTU 和 TBTU;鏻鹽 PyBOP、PyAOP 和 PyClock;以及碳二亞胺與 HOBt、HOAt 或 6-Cl-HOBt 的組合。[31,32]這些試劑提供高偶聯(lián)效率和低氨基酸外消旋化,并且作為固體穩(wěn)定,其中一些甚至在溶液中穩(wěn)定。然而,據(jù)報(bào)道苯并三唑基序具有爆炸性,使得放大和在高溫下工作變得困難。[33]此外,這些試劑的原子效率非常差。
不幸的是,對于肽合成過程中酰胺鍵的綠色形成,目前還沒有通用的解決方案,特別是對于長肽。最大的挑戰(zhàn)之一是肽的復(fù)雜性在過去十年中顯著增加,許多肽產(chǎn)品現(xiàn)在含有超過 30 個(gè)氨基酸。[34]該領(lǐng)域過于廣泛,無法在本展望中詳細(xì)介紹。不斷開發(fā)新的偶聯(lián)試劑,但其可持續(xù)性特性并未經(jīng)過全面測試。圖1描述了具有更可持續(xù)性試劑的相關(guān)例子。氰基(羥基亞氨基)乙酸乙酯“oxyma pure”,[35]它與碳二亞胺結(jié)合使用,其衍生的脲鹽 COMU36[36]通常表現(xiàn)出與苯并三唑?qū)?yīng)物相同或更好的偶聯(lián)效率和更低的氨基酸外消旋化。COMU 的限制之一是它在自動化應(yīng)用中的應(yīng)用,由于其在 DMF 中的不穩(wěn)定性,固相肽合成非常有限。然而,最近的一項(xiàng)研究表明,COMU 在 γ-戊內(nèi)酯中相對穩(wěn)定,這使得它對于更環(huán)保的自動化固相肽合成可能更具吸引力。[37]最后,必須注意另一篇最近的出版物,報(bào)告了差示掃描量熱法(DSC) 研究,將 COMU 歸類為肽生產(chǎn)的“最不優(yōu)選”試劑。[38]因此,COMU 的實(shí)用性仍然存在問題。
圖 1. 更環(huán)保的偶聯(lián)試劑
其他較少使用但相對綠色的偶聯(lián)劑是 TFFH 及其衍生物,可原位生成氨基酰氟并已應(yīng)用于許多固相肽合成,[39]以及在溶液中穩(wěn)定的丙基膦酸酐 (T3P) 并且可以潛在地用于SPPS。[40]
大分子肽商業(yè)合成的現(xiàn)有技術(shù)仍主要使用 DIC/HOBt。然而,“oxyma pure”的使用在工業(yè)上獲得了顯著的吸引力。最后,對酰胺鍵的替代方法也提出了相關(guān)的觀點(diǎn),旨在提高原子效率和與各種溶劑的相容性以及其他性能。[41]這些方法中的大多數(shù)還沒有達(dá)到預(yù)期的綠色,或者還不能完全應(yīng)用于肽的合成,但我們相信這類研究將為更環(huán)保的解決方案鋪平道路。還需要考慮這些潛在的原材料供應(yīng)鏈新方法,例如 Fmoc-氨基酸。
2.1.2 溶劑
溶劑代表了化學(xué)過程中產(chǎn)生的絕大多數(shù)廢物,這與固相肽合成尤其相關(guān)。因此,使用更環(huán)保的溶劑或?qū)ふ覝p少或回收溶劑的方法具有很高的興趣。用于固相肽合成的主要溶劑是 DMF、NMP,以及少量的二氯甲烷、二乙醚和叔丁基甲基醚。所有這些溶劑都存在各種危害。最重要的是,DMF 和 NMP 具有生殖毒性危害,并可能受到歐洲化學(xué)品注冊、評估、授權(quán)和限制條例(范圍)的限制或授權(quán),最終可能會排除這些溶劑的使用。[42]
因此,對合成肽綠色溶劑包括溶劑與其他物質(zhì)的相容性需要進(jìn)行進(jìn)一步的研究。理想的溶劑應(yīng)該能夠溶解所有肽合成試劑,實(shí)現(xiàn)高效的酰胺鍵形成反應(yīng)和脫保護(hù),并使所選的固體支持物溶脹。
近年來,許多更環(huán)保的溶劑已用于肽合成。例如,2-MeTHF(2-甲基四氫呋喃)已被用于在聚乙二醇載體(ChemMatrix)上固相合成 Aib-腦啡肽五肽。偶聯(lián)條件為 2-MeTHF 中的 DIC/Oxyma Pure,并在 2-MeTHF 中用 20% 哌啶去除 Fmoc 基團(tuán)。[43]最近,γ-戊內(nèi)酯已被用作 Aib-ACP 的 SPPS 的 DMF 替代品 ChemMatrix 樹脂上的十肽。[37]在這種情況下,DMF 仍用于洗滌和 Fmoc 去除步驟。有研究者成功在聚苯乙烯和聚乙二醇 (ChemMatrix) 樹脂上使用 20% 哌啶在 γ-戊內(nèi)酯中成功去除 Fmoc。[44]有趣的是,該研究表明,最常見的 Fmoc-氨基酸衍生物可溶于 γ-戊內(nèi)酯 >0.1 M,這使得溶劑可用于自動合成。
碳酸丙烯酯已用于溶液中的肽合成(Boc/Bn 策略)和在 ChemMatrix 樹脂上手動固相合成九肽緩激肽(Fmoc/tBu 策略)。固相偶聯(lián)時(shí)間比平時(shí)長(2×1 h),但在這種情況下,偶聯(lián)和 Fmoc 去除均在碳酸亞丙酯中進(jìn)行。[5]研究組發(fā)表了關(guān)于各種樹脂在綠色溶劑中溶脹的深入研究,這對于未來的綠色肽合成非常有用。[45]
最近,對 DMF 替代 SPPS 的深入研究表明,N-丁基吡咯烷酮 (NBP) 是某些應(yīng)用的合適替代品。[46]突出的缺點(diǎn)之一是NBP的粘度高于已建立的溶劑(如DMF),盡管提出了加熱作為在合成過程中克服該問題的解決方法。然而,盡管替代溶劑具有一定的效果,但大多數(shù)示例都是針對非常短的模型肽。對于大分子肽工業(yè)化合成也有一定的啟示。
對于有毒和有害溶劑使用的可持續(xù)性問題可通過在水中實(shí)現(xiàn) SPPS來解決。在室溫下已有一些成功的案例。[47-50]例如,EDC-HONB 作為偶聯(lián)劑,通過兩性離子去污劑和微波輻射偶聯(lián)某些 Boc 保護(hù)的氨基酸,成功在 PEG 基樹脂上合成 Leu-腦啡肽。[48]納米顆粒形式的 Fmoc-氨基酸也已成功用于在水中進(jìn)行SPPS。[51]一些有助于水性 SPPS 的水溶性保護(hù)基團(tuán)和磺化版本的 Fmoc、Boc 保護(hù)基已獲得相關(guān)專利。[49,52]此外,在有機(jī)溶劑中進(jìn)行偶聯(lián)和脫保護(hù)步驟,并洗滌非水溶劑,以提高工藝的綠色性已獲得有效解決,最大限度地減少與水合成相關(guān)的副反應(yīng)。[53] 同時(shí),對危險(xiǎn)的三氟乙酸可用非氟化產(chǎn)品來替代。
2.1.3 更環(huán)保的固相肽合成的樹脂
樹脂回收主要針對2-氯三苯甲基樹脂進(jìn)行了描述,但據(jù)我們所知,這仍然是一個(gè)非常小的研究領(lǐng)域。[54-56]許多新型綠色樹脂(即基于聚乙二醇的樹脂)的一個(gè)重要特征是它們在大多數(shù)溶劑中,尤其是在三氟乙酸中的溶脹程度明顯更高。這使得單位質(zhì)量樹脂所需的溶劑大得多。與聚乙二醇基樹脂相比,聚-ε-賴氨酸樹脂 SpheriTide 與綠色溶劑的相容性較差。但是,它具有高負(fù)載和可生物降解性,并且樹脂的起始材料來自可再生資源。[45]我們相信理想的樹脂應(yīng)該溶脹到足以使反應(yīng)有效發(fā)生,但溶脹不會超過要求,理想情況下應(yīng)該與更環(huán)保的溶劑相容。
2.1.4 化學(xué)連接
自第一個(gè)天然化學(xué)連接 (NCL) 開發(fā)以來,未受保護(hù)的肽片段,不可能或非常難以合成的長肽和蛋白質(zhì)獲得了合成方法。[57,58]這種合成方法可能會提供更高的產(chǎn)量, 更純凈的原油,減少溶劑的使用。此外,大多數(shù)連接反應(yīng)是可在水性條件下進(jìn)行。
天然化學(xué)連接的最新應(yīng)用包括合成酶 Sortase A 和同位素標(biāo)記的人胰島素。[59-61]SPPS 主要用于連接 C 端含硫酯肽和 N 端含Cys 肽片段。[62]作為 NCL 的延伸,蛋白連接 (EPL) 涉及重組表達(dá)以合成肽或蛋白質(zhì)片段。因此,帶有C末端硫酯的蛋白質(zhì)可以與具有 N 末端 Cys 的合成肽片段連接,可用于合成非天然蛋白質(zhì)。[63,64]總體而言,自 1990 年代初期以來,學(xué)術(shù)界在綠色連接方法方面的進(jìn)展一直很突出。然而,工業(yè)上的牽引力很小。可能鼓勵(lì)工業(yè)采用的關(guān)鍵改進(jìn)是改進(jìn)樹脂的開發(fā)和硫酯的合成。此外,開發(fā)在連接過程中將半胱氨酸脫硫?yàn)楸彼岬木G色方法可以顯著改善范圍。
最后,最近的評論中介紹了幾種有前途的無半胱氨酸肽化學(xué)連接形式(圖2)。[62,65]
圖2. (a) 天然化學(xué)連接;反應(yīng)肽/蛋白質(zhì)片段可以在表達(dá)的蛋白質(zhì)連接中重組獲得。(b) Staudinger (c) Ser/Thr 連接 (R = H/Me)。(d) KAHA (Opr 版本)
? Staudinger :帶有膦的肽硫酯通過與 N 端疊氮化物反應(yīng)形成酰胺鍵。[66,67]這種連接最近已應(yīng)用于聚糖-肽綴合物的合成。[68]
? Ser/Thr :帶有 C 端 o-水楊醛酯的肽通過惡唑烷中間體與含有 N 端 Ser 或 Thr 的肽形成酰胺鍵。[69,70]最近的例子是合成teixobactin 和類似物。[71,72]需要解決的一點(diǎn)是,標(biāo)準(zhǔn)的連接方案要求使用吡啶/醋酸(6:1)。
? KAHA:在C末端帶有α-酮酸的肽與在N末端帶有羥胺的另一個(gè)肽形成天然酰胺鍵。[73]最近的一個(gè)例子是合成高度疏水的抗病毒膜相關(guān)蛋白 IFITM3[74]。
2.1.5 小規(guī)模快速合成的進(jìn)展
通過將試劑和溶劑限制在特定區(qū)域來合成肽,[75]在紙上的溶劑排斥聚四氟乙烯屏障,將各種試劑定位并洗滌在紙的未涂覆部分,使平行流動合成,這也易于紅外輻射(IR)加熱,以提高耦合效率。[76]這是用于篩選目的的可持續(xù)合成肽庫的創(chuàng)新示例。氟混合物合成 (FMS) 已成功應(yīng)用于合成三肽和五肽文庫,使用分體式液相組合合成,以氟-Fmoc (f-Fmoc) 試劑作為編碼標(biāo)簽,實(shí)現(xiàn)快速分離。[77,78]這是不同多肽合成的一個(gè)很好的例子 ,除了線性肽生成方面的進(jìn)展,環(huán)肽文庫也通過 NCL 方法獲得。[79]最后,利用Cys殘基和全氟芳基連接物進(jìn)行聚合的基于snar的多樣性導(dǎo)向側(cè)鏈大環(huán)化反應(yīng),可以快速合成大環(huán)肽庫。[80]
2.1.6 肽生產(chǎn)
2.1.6.1 概述
隨著制藥行業(yè)對肽的興趣日益濃厚,公斤級合成變得相對普遍。[81]在生產(chǎn)規(guī)模上,除了偶聯(lián)效率外,試劑的選擇還取決于安全性和價(jià)格。試劑的等量經(jīng)過仔細(xì)優(yōu)化,以最大限度地減少與 SPPS 中常規(guī)使用過量投入相關(guān)的成本。為了減少多公斤級多肽生產(chǎn)過程中的危險(xiǎn)足跡并降低成本,研究通常致力于用更簡單、更安全的試劑代替碳二亞胺等有毒試劑。一個(gè)很好的例子是使用酰氯和咪唑進(jìn)行酰胺化以生產(chǎn) HIV 蛋白酶抑制劑候選物。[82]通常,會降低試劑當(dāng)量并消除雙重耦合,同時(shí)延長耦合時(shí)間以實(shí)現(xiàn)相同的效率并減少廢物產(chǎn)生。在較小的學(xué)術(shù)規(guī)模和早期藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域,通常使用 2 到 10 當(dāng)量的試劑來確保接近完全的偶聯(lián),而肽的制造過程通常要求使用不超過 30-50% 的過量試劑 每個(gè)耦合。通常對于較小的肽(<10 個(gè)氨基酸),可用液相化學(xué)進(jìn)行優(yōu)化,盡量減少試劑浪費(fèi)。然而,即使對于中等長度的肽,中間體的分離和純化也可能具有挑戰(zhàn)性。已有關(guān)于連續(xù)溶液相肽合成的報(bào)道。通過利用試劑的緩沖水萃取和水溶性 Fmoc 去封閉加合物,避免了傳統(tǒng)溶液化學(xué)的純化挑戰(zhàn)。[83]為了實(shí)現(xiàn)更高的產(chǎn)量,混合 SPPS/LPPS 經(jīng)常用于生產(chǎn)。例如,HIV 膜融合抑制劑 Enfuvirtide/T20 是一種 36 個(gè)氨基酸的肽,通過混合溶液和固相化學(xué)以每年數(shù)噸的規(guī)模進(jìn)行商業(yè)生產(chǎn)。[84]其他例子包括艾塞那肽和利拉魯肽的混合 SPPS/LPPS 工藝。[85-87]通常,開發(fā)了多種途徑和工藝來應(yīng)對大規(guī)模肽合成的挑戰(zhàn)。一個(gè)典型的例子是奧曲肽的合成,一種SRIF 激動劑的環(huán)狀八肽。[88]
2.1.6.2 肽合成的指標(biāo)
據(jù)報(bào)道,肽生產(chǎn)中的廢物熱電聯(lián)產(chǎn)為每公斤肽[89,90]數(shù)量級,而小分子合成的廢物為數(shù)百公斤數(shù)量級。[91]
一句行之有效的管理格言是“你無法管理你不衡量的東西”。然而,盡管在肽制造中明確需要度量標(biāo)準(zhǔn),但一直沒有顯著的應(yīng)用。工藝質(zhì)量強(qiáng)度 (PMI)[92]和完全 E 因子 (cEF)[93,94]已成為小分子藥物合成中副產(chǎn)工藝廢物的主要衡量標(biāo)準(zhǔn),最近被整合為創(chuàng)新綠色愿望水平 (iGAL) 的基本要素。iGAL 代表了第一個(gè)使用 100 美元/mol 起始材料規(guī)則的標(biāo)準(zhǔn)化工藝廢物分析,它通過藥物復(fù)雜性和開發(fā)階段調(diào)整后的工藝與行業(yè)平均水平的比較來量化相對工藝綠色度 (RPG = iGAL/cEF),因此, 它可以通過綠色化學(xué)創(chuàng)新記分卡輸出公平的綠色工藝評級,該記分卡可在 ACS 網(wǎng)站上免費(fèi)訪問。[95]此外,記分卡通過 RPG 升級的程度和當(dāng)前制造過程與早期版本相比的浪費(fèi)減少量,來量化過程科學(xué)家的創(chuàng)新影響。作為起點(diǎn),鼓勵(lì)合同制造組織 (CMO) 和制藥公司開始為其制造過程收集 PMI/cEF 數(shù)據(jù)。
為了了解肽與小分子合成中的共生廢物量并有意義地評估其 RPG,因此應(yīng)該應(yīng)用 iGAL 方法。然而,分析的障礙是 iGAL 的 100 美元/mol 起始材料規(guī)則,因?yàn)橘徺I的肽構(gòu)建塊通常 超過這個(gè)“商品類型”的限制,需要付出巨大的努力來確定與這些構(gòu)件的生產(chǎn)相關(guān)的廢物。幸運(yùn)的是,肽與小分子不同,我們正在處理數(shù)量有限的常見構(gòu)建塊。因此,一個(gè)可行的解決方案是創(chuàng)建一個(gè) iGAL 清單,其中包含常見肽構(gòu)建塊的內(nèi)在 cEF,以標(biāo)準(zhǔn)化和促進(jìn)分析。ACS GCI PR 正在努力在其網(wǎng)站上提供常見的氨基酸 iGAL 清單。肽藥物的 iGAL 分析結(jié)果將在適當(dāng)時(shí)候報(bào)告。圓桌會議的未來工作還將針對收集肽藥物制造過程的指標(biāo)數(shù)據(jù)并報(bào)告數(shù)據(jù)。
2.2
新型肽合成方法
由于合成過程中的失敗模式,線性SPPS的效率普遍下降,特別是對于序列>15個(gè)氨基酸殘基。[84]這對產(chǎn)品純化復(fù)雜性和整體工藝收率有相應(yīng)的影響。此外,疏水性氨基酸序列問題可能會限制總產(chǎn)量。這通??梢詺w因于樹脂上的聚集現(xiàn)象。在大多數(shù)情況下,這些問題可以通過結(jié)合肽專業(yè)知識、經(jīng)驗(yàn)和幾十年的SPPS調(diào)查收集的知識來克服。然而,冗長的線性綜合具有很高的內(nèi)在風(fēng)險(xiǎn),因?yàn)橐粋€(gè)錯(cuò)誤可能會導(dǎo)致全部損失。在合同制造組織中,大分子肽(>30-mer)化學(xué)合成的失敗率估計(jì)約為20%。上述化學(xué)連接方法和混合 SPPS/LPPS 策略可以解決其中一些問題,但顯然仍然需要替代方法和技術(shù),以最終提高整體效率并減少肽合成和生產(chǎn)對環(huán)境的影響。[7,96,97]
2.2.1 流動中的肽合成
流動化學(xué)具有綠色證書,因?yàn)榭焖賯鳠峥蓽p少能源使用和反應(yīng)時(shí)間,從而減少整體環(huán)境影響。由于用于小規(guī)模肽和蛋白質(zhì)合成的填充床流 SPPS 的迅速發(fā)展和實(shí)施,最近在肽合成[98,99]中的 SPPS 流研究的復(fù)興已經(jīng)很明顯了。[100]這些成就,包括復(fù)雜蛋白的超快速合成[101]和全系統(tǒng)自動化[102],重新振興了一個(gè)研究領(lǐng)域。在 Merrifield 的 SPPS 概念扎根于研究實(shí)驗(yàn)室[103,104]并專注于在線反饋、減少材料使用、和自動化。[105]到目前為止,很少有關(guān)于流動中可擴(kuò)展 SPPS 的報(bào)告,[106,107]盡管正在嘗試使用連續(xù)帶方法來糾正這一問題,通過連續(xù)專門設(shè)計(jì)的反應(yīng)器單元進(jìn)料。[108]
使用 LPPS,以便快速、高效和低浪費(fèi)的方式快速合成小肽片段。[109,110]對于使用低成本、通過 N 羧酸酐提高原子效率的氨基酸活化 (NCAs) 進(jìn)行了調(diào)查, 結(jié)果證明使用連續(xù)攪拌釜反應(yīng)器 (CSTR) 裝置和水性反應(yīng)介質(zhì)合成二肽和三肽的高通量、生產(chǎn)率和PMI 顯著降低 (>100 倍)。[111]
將流動化學(xué)用于混合 SPPS/LPPS 肽工藝是一項(xiàng)具有吸引力的選擇。在樹脂上生產(chǎn)小片段(<10-mers)可能是理想的工藝中間體或監(jiān)管起始材料,這些材料純度高,穩(wěn)定,并且不需要專門的運(yùn)輸或儲存條件。這些片段將從樹脂上切割下來并通過 LPPS 與其他片段偶聯(lián)。Enfuvirtide/T20 生產(chǎn)是利用這種通用策略的批處理過程的一個(gè)典型例子。[84]
2.2.2 綠色標(biāo)簽輔助 LPPS(標(biāo)簽 LPPS)
在 Merrifield 對肽合成領(lǐng)域做出開創(chuàng)性的 SPPS 貢獻(xiàn)后不久,新發(fā)明方法的局限性(主要是副反應(yīng)和大量試劑過量以克服固相基質(zhì)擴(kuò)散并實(shí)現(xiàn)所需的高耦合轉(zhuǎn)化率)推動了對改進(jìn) LPPS 方法研究。使用可溶性“標(biāo)簽”,例如聚苯乙烯(PS,無交聯(lián))[112]和聚乙二醇 (PEG),[113,114]為生長受保護(hù)的肽鏈提供增溶錨,從而產(chǎn)生均勻的溶液動力學(xué),從而可能減少對大量過量試劑的需求 SPPS。在可溶性 PS 的情況下通過沉淀或結(jié)晶實(shí)現(xiàn)偶聯(lián)循環(huán)之間的副產(chǎn)物和試劑的去除(通過在 SPPS 中的樹脂洗滌實(shí)現(xiàn))。盡管溶劑膜存在不相容性問題,且UF 循環(huán)時(shí)間太長,但超濾 (UF) 使用膜技術(shù)也還是獲得了成功。[113-115]
標(biāo)簽輔助 LPPS 概念在過去十年中得到了進(jìn)一步發(fā)展。[116-119]這些小組從上述早期工作和先前在組合化學(xué)中使用定義結(jié)構(gòu)的親脂性“標(biāo)簽”獲得了靈感。[120]圍繞這種肽合成方法的廣泛應(yīng)用仍然存在問題,特別是所選“標(biāo)簽”是否可以為肽延伸提供所需的普遍溶解度。Chiba 等人的研究指出,在實(shí)踐中,需要物理壓力(使用連接的玻璃注射器)來調(diào)動不斷增長的彈性蛋白肽鏈,使其足以進(jìn)行合成。[121]Kent 等人發(fā)表了一篇文章作為回應(yīng),他們認(rèn)為交聯(lián)固體支持物提供的通用增溶能力意味著 SPPS 仍將是肽合成的主要方法。[122]然而,也有報(bào)道稱, 與等效的 SPPS 方法相比,“標(biāo)記 LPPS”方法可以將 20 聚體肽的溶劑浪費(fèi)減少 12 倍以上。[123]這是通過增加錨定分子的親脂性來實(shí)現(xiàn)的,錨定分子具有長烷基鏈作為 C 末端保護(hù)基團(tuán),從而合成肽,其中中間體通過溶劑萃取而不是沉淀分離。[123]同時(shí),對Fmoc 去除條件進(jìn)行了優(yōu)化,以促進(jìn)通過堿性水洗去除二苯并富烯加合物。通過在硫代蘋果酸存在下使用 DBU 去除 Fmoc 以形成水溶性二苯并富烯加合物。[123]
最后,描述了一種相關(guān)的方法——基團(tuán)輔助純化 (GAP),它使用三苯基氧化膦“標(biāo)簽”來沉淀生長的肽鏈,包括回收“標(biāo)簽”的潛力,從而可能減少合成過程中的總體浪費(fèi)。[124]
2.2.3 有機(jī)納濾/基于膜的反應(yīng)器系統(tǒng)
在1970年代,膜的有機(jī)溶劑相容性首次被研究,其發(fā)展[125]重新點(diǎn)燃了對去除肽合成副產(chǎn)物和試劑的研究,[126,113]PEG標(biāo)簽再次用于標(biāo)簽輔助LPPS,在耦合和纖維膜循環(huán)之間的定體積透濾系統(tǒng)中使用了幾種不同的膜類型。這在兩個(gè)小肽(4 聚體和 5 聚體)上得到了證明。同時(shí)發(fā)現(xiàn)了減少肽制造過程中產(chǎn)生的高溶劑廢物負(fù)擔(dān)的潛力。在高稀釋肽環(huán)化反應(yīng)的背景下,進(jìn)一步研究和證明了這種溶劑浪費(fèi)的減少。[127]
最近,該領(lǐng)域發(fā)表的工作側(cè)重于對 MEPS 工藝參數(shù)的理解,以控制和減少合成中的故障模式。[128]此外,MEPS 中使用的“標(biāo)簽”的進(jìn)一步開發(fā)已經(jīng)發(fā)表,超越了線性聚合物(如 PEG、PS ) 到支鏈錨,目的是降低生長肽鏈的滲透性,從而減少通過膜的產(chǎn)量損失。[129]
2.2.4 酶肽連接
化學(xué)酶促合成多年來一直是一個(gè)研究領(lǐng)域,有望實(shí)現(xiàn)高特異性、[130]溫和的反應(yīng)條件和減少的廢物流。各種連接酶(如分選酶、丁酸酶、肽連接酶或全連接酶)能夠?qū)崿F(xiàn)化學(xué)選擇性肽連接。最近,EnzyPep B.V. 對其進(jìn)行了改進(jìn)和證明,以催化有效的肽環(huán)化和無保護(hù)肽片段的無痕縮合,用于中到大型肽靶標(biāo)的合成。[131,132]這種片段縮合方法的實(shí)際好處主要是水性偶聯(lián)條件下使用未受保護(hù)的肽片段,避免了阻礙更傳統(tǒng)化學(xué)片段縮合方法的溶解度問題。胸腺素α 和艾塞那肽的合成被證明可行。[133]
2.2.5 機(jī)械化學(xué)
機(jī)械化學(xué)通過誘導(dǎo)的機(jī)械能(例如,通過在球磨機(jī)中研磨所有反應(yīng)物)促進(jìn)固體之間的反應(yīng),并且該領(lǐng)域自 1990 年以來一直在迅速擴(kuò)大。[134-137]評估了無溶劑合成或最小溶劑合成(液體輔助研磨) 通過與 α-氨基酸、酰胺、 或球磨機(jī)中的酯類。[138-141]此外,該反應(yīng)顯示了使用機(jī)械化學(xué)和流動化學(xué)原理的短肽(2-3 個(gè)氨基酸)應(yīng)用的機(jī)械化學(xué)演變。[142]研究表明,機(jī)械化學(xué)是一種環(huán)境友好的替代方法,可用于制備高濃度的短肽,差向異構(gòu)化率低。
03
分離純化方法的可持續(xù)性
肽的純化和/或分離通常是制造過程的瓶頸。此外,還會產(chǎn)生大量高放水/低有機(jī)廢物。
3.1
高效液相色譜法(HPLC)
HPLC 是肽純化和反離子交換最常用的技術(shù)。[143]反相 (RP) 和離子交換 (IEX) 色譜法是純化肽的首選,可提供高分辨率、穩(wěn)健性和輸出重現(xiàn)性。然而,肽與柱填料的相互作用與有機(jī)小分子的相互作用顯著不同。目前市場上有用于肽純化的混合模式色譜 (MMC) 柱,其中溶質(zhì)在分離過程中與固定相有不止一種相互作用。這些相互作用不僅是疏水的或離子的,而且是疏水/離子、疏水/親水、親水/離子(I-IV 型混合珠)。[144]混合模式色譜可用作 RP、IEX 或正相色譜純化肽的替代或補(bǔ)充技術(shù)。[145]
與 MMC 類似的技術(shù)是摻雜反相色譜法 (DRP)。DRP色譜使用不同的配體(一種離子交換配體類型和一種反相配體類型),與MMC相比具有更多優(yōu)勢,因?yàn)榭梢酝ㄟ^改變其中一種的摻雜濃度來改變?nèi)苜|(zhì)和固定相之間的相互作用機(jī)制。其次,它可以用于吸引-排斥模式,其中離子交換基團(tuán)對分析物處于排斥模式。[146]最后,使用多柱逆流溶劑梯度純化(MCSGP)色譜法證明了肽的純化。重疊餾分的內(nèi)部循環(huán)和再分離提高了產(chǎn)量和生產(chǎn)率,同時(shí)減少了溶劑消耗。[147]
與標(biāo)準(zhǔn) RP-HPLC 相比,MMC 和 MCSGP 技術(shù)表現(xiàn)出更快的分離速度、更高的產(chǎn)量和更高效的工藝。此外,它們還減少了有害廢物的產(chǎn)生、水的消耗,并減少了凈化過程的循環(huán)時(shí)間。
3.2
超臨界流體色譜 (SFC)
與傳統(tǒng) HPLC 相比,SFC 具有多項(xiàng)優(yōu)勢,例如速度快、可實(shí)際使用更長的色譜柱、正相保留機(jī)制以及減少有機(jī)溶劑的使用。SFC 可用于純化多達(dá) 40 聚體的肽,包括線性和環(huán)狀。它使用 CO2 作為帶有改性劑(例如甲醇、乙醇、2-丙醇)和添加劑(例如 TFA 或乙酸銨)的流動相。[148,149]Zheng等人認(rèn)為,流動相修飾劑的酸度是關(guān)鍵的,TFA添加劑的含量隨多肽的不同而變化。與HPLC相比,SFC在綠色色譜方面似乎是一種很有前途的技術(shù),因?yàn)樵赟FC純化過程中使用的二氧化碳具有回收利用的可能性(到目前為止,仍是一個(gè)未解決的話題)。與目前的凈化方法相比,SFC產(chǎn)生不到三分之一的有機(jī)廢物,具有環(huán)保性質(zhì)。[150]同樣的工作還報(bào)告說分析時(shí)間減少了 5 倍。SFC 的其他優(yōu)點(diǎn)包括:使用較少毒性的改性劑,實(shí)現(xiàn)更好的手性化合物分離度和 CO2 的特殊屬性,例如不易燃、無毒,并且成本低于大多數(shù)有機(jī)溶劑。這種技術(shù)的缺點(diǎn)包括較高流速產(chǎn)生的熱量可能會降低分辨率,并且沒有多少涉及肽的研究可用。
3.3
液-液萃取 (LLE)
LLE,也稱為溶劑萃取,是在液相肽合成中分離中間體的最古老和最廣泛使用的方法。[151]多年來,為了最大限度地提高萃取效率和減少溶劑,已經(jīng)開發(fā)了一系列 LLE 改進(jìn) 消費(fèi)和生產(chǎn)成本。相關(guān)的例子是連續(xù)流動系統(tǒng)中的液-液萃取,[152,153]水力旋流器中的微滴旋轉(zhuǎn),[154]攪拌/攪拌萃取柱[155]和混合沉降器。[156]這些可替代的LLE程序尚未廣泛應(yīng)用于多肽的合成,或研究結(jié)果尚未發(fā)表。
另一方面,ELLE(對應(yīng)選擇性液-液萃?。┩ǔS糜诜蛛x包括氨基酸在內(nèi)的對映異構(gòu)體。[157]此外,離子液體-有機(jī)溶劑萃取被應(yīng)用于二肽和三肽的純化,實(shí)現(xiàn)了良好的分離,并利用離子液體的循環(huán)特性。[158]
3.4
進(jìn)行的案例研究
3.4.1 通過沉淀過程消除離子交換色譜法
由于肽的裂解和反相純化技術(shù)的性質(zhì),由SPPS生產(chǎn)的肽通常作為其TFA鹽制備。[159]離子交換色譜法是將肽 TFA 鹽轉(zhuǎn)化為藥學(xué)上可接受的鹽的標(biāo)準(zhǔn)方法。[160]就安進(jìn)公司的 etelcalcetide(圖3)而言,將肽 TFA 鹽轉(zhuǎn)化為最終的 HCl 鹽涉及使用醋酸樹脂進(jìn)行離子交換層析以形成醋酸鹽,然后在稀 HCl 中進(jìn)行幾次凍干循環(huán)以去除醋酸 并用氯化物交換醋酸鹽。這種兩步轉(zhuǎn)化過程雖然有效,但能量和體積密集,離子交換本質(zhì)上是稀釋的,并且通常需要多次凍干以去除乙酸。整個(gè)兩步過程在商業(yè)規(guī)模上可能需要數(shù)周時(shí)間,必要的水量和巨大的凍干能力需求是大規(guī)模肽生產(chǎn)的主要瓶頸,對滿足商業(yè)藥物需求構(gòu)成重大風(fēng)險(xiǎn)。
圖3. etelcalcetide的結(jié)構(gòu)
Amgen 和 Bachem 合作開發(fā)了一種值得注意的解決方案,解決兩步的大體積離子交換/凍干序列。[161]對起始材料和產(chǎn)品的表征揭示了兩者之間的顯著溶解度差異 etelcalcetide-TFA鹽和所需的鹽酸鹽;TFA 鹽在2-丙醇中的溶解度為100 mg/mL,而鹽酸鹽在同一溶劑中的溶解度為<1mg/mL。通過利用小分子溶解度和結(jié)晶工程原理,該團(tuán)隊(duì)能夠設(shè)計(jì)所需的 HCl 鹽在 2-丙醇水溶液中的受控沉淀。將 etelcalcetide-TFA 鹽作為 2-丙醇水溶液中的溶液加入溶液中HCl 在 2-丙醇中的濃度;然后通過過濾分離 etelcalcetide-HCl。最終結(jié)果是一個(gè)將 TFA 鹽直接轉(zhuǎn)化為 HCl 最終形式的實(shí)用過程。新的、更環(huán)保的分離工藝完全消除了離子交換色譜和每批原料藥 12 個(gè)凍干循環(huán)。通過消除對離子交換的需要,該過程的水負(fù)擔(dān)顯著降低;用于臨床生產(chǎn)的原始離子交換工藝每克原料藥需要超過 3 L 的水。該工藝在商業(yè)規(guī)模上能夠在標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)器和過濾干燥器中進(jìn)行。直接鹽轉(zhuǎn)化工藝使 etelcalcetide 的生產(chǎn)能力提高了 10 倍。
3.4.2 環(huán)肽的無色譜純化
大環(huán)肽在治療領(lǐng)域非常重要,因?yàn)樗鼈兊拇笮『腿壗Y(jié)構(gòu)使其成為調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的理想選擇。[162]這個(gè)簡短的案例研究將強(qiáng)調(diào)通過化學(xué)創(chuàng)新提高純大環(huán)肽分離的重要進(jìn)展。[163]通過取代溶劑密集型色譜,該技術(shù)極大地提高了獲取大環(huán)肽的綠色性。這是值得注意的,因?yàn)榕c色譜相關(guān)的溶劑使用占 PMI 的很大一部分。在這項(xiàng)由 BMS 創(chuàng)新資助資助的 Bristol-Myers Squibb 研究中,全長合成肽在 N 末端用正交雙模式接頭進(jìn)行修飾,該接頭能夠首先實(shí)現(xiàn)線性肽的固相“捕獲”,然后是堿基 介導(dǎo)的環(huán)化和同時(shí)“釋放”所需的純肽大環(huán)化合物。應(yīng)變輔助疊氮化物-炔烴環(huán)加成 (SPAAC) 被證明是一種通用的正交捕獲技術(shù),可廣泛應(yīng)用于各種大小的各種目標(biāo)肽(5-20 元件演示)(圖4)。
圖4. 捕獲釋放純化的“邏輯門”方法
04
結(jié)論
近年來,減少尖端藥物化學(xué)合成生產(chǎn)中的復(fù)雜性,對環(huán)境影響的創(chuàng)新方法,兩者相匹配的研究已成為研究熱點(diǎn)。限制化學(xué)品對人類和環(huán)境的負(fù)面影響是全球努力的重要部分,對于研究和生產(chǎn)中常用的試劑、溶劑和樹脂的綠色安全性有了更高的標(biāo)準(zhǔn)。目前學(xué)術(shù)界和工業(yè)界在更環(huán)保的肽合成和純化領(lǐng)域都取得了相關(guān)進(jìn)展。然而,綠色肽化學(xué)仍然是一個(gè)相對較小的研究領(lǐng)域,其中許多進(jìn)展需要很長時(shí)間才能應(yīng)用于肽的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)。因此,不僅要在綠色肽化學(xué)領(lǐng)域投入更多資源,而且需要在學(xué)術(shù)界、工業(yè)界、制藥業(yè)和 CRO/CMO 之間建立更多的協(xié)同效應(yīng)。最后,重要的是決策者要調(diào)和這樣的想法,環(huán)保的方法不僅對環(huán)境更好,而且在時(shí)間和成本方面也會更加有效。
原文鏈接:DOI:10.1021/acs.joc.8b03001
不可否認(rèn),可持續(xù)與綠色化學(xué)合成多肽將成為未來發(fā)展的趨勢,與此同時(shí),多肽制備工藝將得到進(jìn)一步發(fā)展和提高。作為多肽行業(yè)的從業(yè)者,湃肽已經(jīng)采取了一些通過實(shí)施綠色化學(xué)來減少對環(huán)境影響的步驟,助推多肽行業(yè)健康發(fā)展。未來,我們也將不斷的關(guān)注、研究、嘗試新的技術(shù)發(fā)展方向,并從中選擇適合自己的道路。
參考文獻(xiàn):
Albert Isidro-Llobet, et al., Sustainability Challenges in Peptide Synthesis and Purification: From R&D to Production. The Journal of Organic Chemistry.2019, 84, 4615-4628.
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